MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Enterococcus faecalis V583 plasmid pTEF1

Total Repeats: 364

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004669	AAT	2	6	16	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004669	A	7	7	36	42	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004669	TAAA	2	8	53	60	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004669	AATTTA	2	12	1129	1140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004669	GGA	2	6	1142	1147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004669	TAA	2	6	2323	2328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004669	AGG	2	6	2332	2337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004669	AATTT	2	10	2338	2347	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004669	A	6	6	4964	4969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004669	T	6	6	4987	4992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004669	T	7	7	4995	5001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004669	TAA	2	6	5008	5013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004669	T	7	7	5015	5021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004669	TTTATT	2	12	5052	5063	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004669	TAT	2	6	5075	5080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004669	TAAGT	2	10	5088	5097	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004669	GA	3	6	5233	5238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004669	T	6	6	5252	5257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004669	CTA	2	6	5394	5399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_004669	AAT	2	6	5413	5418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004669	AGG	2	6	5432	5437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004669	TTTA	2	8	6154	6161	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004669	ATAA	2	8	6201	6208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004669	ACAA	2	8	6272	6279	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_004669	TATT	2	8	6295	6302	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004669	ATT	2	6	7131	7136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004669	TAC	2	6	7142	7147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_004669	AGC	2	6	7221	7226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_004669	AGG	2	6	7419	7424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004669	A	6	6	7458	7463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004669	ATT	2	6	7523	7528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004669	TAAA	2	8	7547	7554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004669	TCC	2	6	8270	8275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_004669	TAT	2	6	8289	8294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004669	TAG	2	6	8309	8314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004669	AAC	2	6	8339	8344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_004669	T	6	6	8352	8357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004669	A	6	6	8363	8368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004669	CT	3	6	8384	8389	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_004669	TTTTGA	2	12	8392	8403	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004669	A	6	6	8435	8440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004669	T	7	7	8446	8452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004669	AAT	2	6	8465	8470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004669	AAT	2	6	8504	8509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004669	TAT	2	6	8516	8521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004669	AAT	2	6	8524	8529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004669	TAT	2	6	8536	8541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004669	CAAGA	2	10	8542	8551	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_004669	ACCT	2	8	8579	8586	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_004669	TATT	2	8	8644	8651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004669	TAA	2	6	8693	8698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004669	CCA	2	6	9098	9103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_004669	A	7	7	9107	9113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004669	TGG	2	6	9119	9124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004669	TCTTT	2	10	9153	9162	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_004669	ATC	2	6	9188	9193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_004669	T	6	6	9199	9204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004669	ATT	2	6	9216	9221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004669	T	6	6	9341	9346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004669	A	7	7	9385	9391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004669	A	6	6	9425	9430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004669	GTG	2	6	9431	9436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004669	T	6	6	9455	9460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004669	CGA	2	6	9470	9475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_004669	GAAA	2	8	9485	9492	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004669	AATA	2	8	9493	9500	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004669	A	6	6	9516	9521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004669	T	6	6	9551	9556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004669	TTTTAA	2	12	9565	9576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004669	A	6	6	9610	9615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004669	AAAT	3	12	9660	9671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004669	T	6	6	9696	9701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004669	A	6	6	9739	9744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004669	A	6	6	9810	9815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004669	A	6	6	9817	9822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004669	TCT	2	6	10744	10749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_004669	AT	3	6	10777	10782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004669	AAC	2	6	10785	10790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_004669	TAAA	2	8	10810	10817	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004669	TCC	2	6	11533	11538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_004669	TAT	2	6	11552	11557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004669	AATA	2	8	12068	12075	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004669	TCC	2	6	12240	12245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_004669	TAAT	2	8	12340	12347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004669	GTA	2	6	12396	12401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004669	A	6	6	12456	12461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004669	CTA	2	6	12471	12476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_004669	CAA	2	6	12487	12492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_004669	T	7	7	12505	12511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004669	CAA	2	6	12533	12538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_004669	ATT	2	6	12540	12545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004669	GTTG	2	8	12556	12563	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004669	TTC	2	6	13320	13325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_004669	TAAA	2	8	13361	13368	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004669	CAA	2	6	13375	13380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_004669	ATT	2	6	13777	13782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004669	T	6	6	13822	13827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004669	GC	3	6	13831	13836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_004669	ACG	2	6	13841	13846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_004669	GC	3	6	13864	13869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_004669	A	6	6	13873	13878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004669	CTT	2	6	14370	14375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_004669	T	6	6	14381	14386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004669	T	6	6	14401	14406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004669	AATA	2	8	14413	14420	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004669	T	7	7	14437	14443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004669	CCT	2	6	14478	14483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_004669	CTT	2	6	14547	14552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_004669	CTT	2	6	14556	14561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_004669	T	6	6	14607	14612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004669	TTC	2	6	14647	14652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_004669	TTC	2	6	14655	14660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_004669	GTT	2	6	14675	14680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004669	TGT	2	6	14693	14698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004669	TCC	2	6	14744	14749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_004669	GTC	2	6	14788	14793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_004669	GTT	2	6	14817	14822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004669	T	7	7	14821	14827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004669	TTC	2	6	14845	14850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_004669	CT	3	6	14854	14859	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_004669	CAT	2	6	14925	14930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_004669	TAG	2	6	14978	14983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004669	CTT	2	6	15036	15041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_004669	AAT	2	6	15063	15068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004669	AAT	2	6	15072	15077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004669	T	6	6	15120	15125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004669	AGCATA	2	12	15128	15139	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_004669	GTTGG	2	10	15146	15155	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004669	TTC	2	6	15191	15196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_004669	TAA	2	6	15198	15203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004669	T	6	6	15217	15222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004669	TCGT	2	8	15244	15251	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_004669	AGT	2	6	15277	15282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004669	A	6	6	15420	15425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004669	ACT	2	6	15442	15447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_004669	ACGA	2	8	15622	15629	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_004669	T	7	7	15691	15697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004669	TGG	2	6	15699	15704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004669	TTTTG	2	10	15741	15750	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004669	A	6	6	15787	15792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004669	TGGG	2	8	15798	15805	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004669	T	6	6	15822	15827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_004669	AATT	2	8	16685	16692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_004669	AAC	2	6	17088	17093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_004669	AGT	2	6	17102	17107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_004669	AAC	2	6	17233	17238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_004669	C	6	6	17310	17315	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
148	NC_004669	GTT	2	6	17334	17339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_004669	GT	3	6	17351	17356	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_004669	A	6	6	17399	17404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_004669	TA	3	6	17425	17430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_004669	T	6	6	17437	17442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_004669	AACA	2	8	17462	17469	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.